Witam, chciałbym jedną subdomenę wyłączyć spod wordpress'a tak aby była obsługiwana przez inny vhost apache'a.

Teraz jest tak że wszystkie domeny i subdomeny są pod kontrolą WPMU (swoją drogą zastanawiam się jak to możliwe, bo WPMU mam zainstalowany pod powiedzmy vhost domena1.pl + aliasy typu domena2.pl, domena3.pl a działa to tak że absolutnie wszystkie domeny skierowane na serwer (IP) są obsługiwane przez WPMU, czyli domena_x.pl też chociaż wcale bym tego nie chciał) a potrzebuję zrobić tak że np. wiki.domena1.pl była obsługiwana przez inny vhost, który stworzyłem, jest poprawny ale i tak apache wyświetla domena1.pl.

Do WPMU doinstalowałem domain mapping.

To raczej kwestia zarządzania domenami, niż WPMU, na niektórych hostingach czy w niektórych firmach w których zarządza się domenami, jest możliwość kierowania konkretnych subdomen na inne IP lub inne DNSy niż wszystkie pozostałe.

Dokładnie tak - to w całości kwestia konfiguracji serwera WWW a nie skryptu.

hmm... wykorzystuję VPS z jednym IP, domeny są ustawione za pomocą freeDNS.42.pl rekord A wskazuje IP VPS'a, tak jest w przypadku wszystkich moich domen, zanim nie zacząłem korzystać z WPMU, działało to fajnie bo w apache mogłem stworzyć dowolną ilość vhost'ów każdy vhost mógł być przypisany do jednej domeny lub wielu za pomocą aliasów, a po aktywacji WPMU niezależnie od tego do jakiego vhost'a jest przypisana domena to i tak apache zawsze wyświetla tego vhost'a na którym jest WPMU pomimo że dana domena nie jest jego aliasem... Dla testu wyłączyłem vhost'a z WPMU i wszystkie pozostałe domeny działają tak jak są skonfigurowane w apache więc zgaduję że to wina WPMU.

To co napisałeś wprost dowodzi, że przyczyną Twoich problemów jest konfiguracja wirtualki z multisite'owym WP. Najprawdopodobniej jest ładowana w konfiguracji serwera WWW jako pierwsza, a że została skonfigurowana do zbierania wszystkich możliwych domen więc je zbiera i przekierowuje na WP